Одјељење за нематеријалну културу
Одјељење чува живу традицију и изразе који представљају срце културе. Истражује, документује и чува нематеријална блага - од ритма музике и мудрости говорног језика до ситних детаља старих заната. Кроз стручну експертизу и брижљиво прикупљање, залаже се за њихову заштиту, осигуравајући да ово културно насљеђе настави да обогаћује будуће генерације.
Одјељење за материјалну културу
Одјељење проводи систематска истраживања, евидентира, предлаже и утврђује статус покретних културних добара. Бави се прикупљањем, организацијом, чувањем, стручном и научном обрадом музејског материјала добијеног теренским истраживањима, ископавањима, куповином, донацијама, насљеђивањем, размјеном, оставштином и копирањем. Одјељење је такође задужено за систематско организовање, чување и заштиту стручне и научне документације о музејском материјалу и покретним културним добрима, као и за објављивање резултата стручног и научног рада. Активности одјељења обухватају и излагање и тумачење музејског материјала у сталној поставци и тематским изложбама, с циљем унапређења образовања и културе.
Одјељење за библиотечку и издавачку дјелатност.
Одјељење за библиотечку и издавачку дјелатност обавља послове систематске набавке научне и стручне литературе из музеологије и других научних дисциплина заступљених у Музеју, прије свега за потребе стручних радника Музеја Републике Српске. Такође се стара о размјени литературе, књига, каталога и свих публикација са сродним музејским установама у земљи и иностранству. У надлежности Одјељења је и заштита старих и ријетких књига које, у складу са законом, имају статус културног добра и музејске грађе. Поред тога, Одјељење обавља послове издавачке дјелатности - уређивања, дизајна и штампе музејских издања.
Одјељење за конзервацију и рестаурацију
Одјељење за конзервацију и рестаурацију бави се очувањем и обновом покретних културних добара и музејске грађе од различитих материјала - метала, керамике, камена, кости, текстила, дрвета и других. У Одјељењу се врше испитивања културних добара и музејске грађе: њиховог састава, техника израде, стања предмета и узрока њиховог пропадања.
Одјељење за документацију и дигитализацију
Одјељење за документацију и дигитализацију обавља послове вођења евиденције о културним добрима, документације о музејској грађи, те вођење Регистра културних добара Музеја Републике Српске као и вођење Централног регистра културних добара за културна добра по врстама за које је законом одређена надлежност Музеја Републике Српске.
Одјељење за образовно-педагошки рад, комуникације и односе са јавношћу
Одјељење за образовно-педагошки рад, комуникације и односе са јавношћу надлежно је за односе с јавношчћу, те за организацију посјета изложбама и за све манифестације, радионице, семинаре, предавања и друге облике просвјетно-педагошке дјелатности.
Одјељење за заједничке послове
Одјељење за заједничке послове обавља опште, управно-правне, административне и кадровске послове за потебе Музеја. Надлежност Одјељења су финансијски, рачуноводствени, материјални, обрачунски и благајнички послови, те набавке, евиденције о основним средствима, инвентару и имовини Музеја; послови техничког одржавања објекта, инсталација и инвентара, обезбјеђење транспорта музејске грађе и других вриједности на подручју Републике Српске, Босне и Херцеговине и иностранству. Дјелатност одјељења укључује и обављање послова везаних за промоцију Музеја и његове дјелатности путем медија и на тржишту идеја и услуга, маркетиншке послове те продају музејских издања и сувенира.
